Regio III
Dit is het grootste gebied in het hele hypogeumcomplex, dat dateert uit de 4e eeuw. Het strekt zich voornamelijk uit onder het klooster dat verbonden is met de basiliek en de Via Nomentana. Deze regio was ooit verbonden met het nabijgelegen Coemeterium Maius. Het gebied werd relatief intact gevonden door Armellini, de eerste die het opgroef, dankzij een laag slib die het beschermde tegen de graafmachines. Tegenwoordig worden veel artefacten die in deze regio zijn ontdekt tentoongesteld in de Vaticaanse Musea.