Katakomberna i Saint Agnes | Viloplats för den jungfruliga martyren

Detta är den äldsta delen av katakomben, med anor från 300-talet. Den ligger under Via di Sant'Agnese och var en del av den pre-konstantinska epoken. Trots avsaknaden av betydande målningar är detta område rikt på epigrafiska bevis som ger värdefull insikt i de tidiga kristnas begravningsseder och bruk.

Detta område började utvecklas på 400-talet, men det drabbades av betydande skador på grund av relikjägare. Effekterna av dessa olagliga aktiviteter är uppenbara i regionens förändrade topografi och förlusten av potentiella historiska Artefakter.

Detta är den största regionen i hela hypogeumkomplexet, med anor från 400-talet. Den sträcker sig huvudsakligen under klostret i samband med Domkyrkan och Via Nomentana. Denna region var en gång i tiden kopplad till det närliggande Coemeterium Maius. Regionen hittades relativt intakt av Armellini, den förste som grävde ut den, på grund av ett lager av silt som bevarade den från grävskoporna. Idag visas många Artefakter som upptäckts i denna region i Vatikanmuseerna.

Region IV ligger mellan den nuvarande basilikan och ruinerna av Konstantins basilika. Denna region utvecklades efter att kejsar Konstantin byggt sin basilika, vilket ledde till att den hedniska nekropolen ovanför katakomben förstördes. Intressant nog användes många plattor med inskriptioner från den hedniska kyrkogården för att bygga trapporna som når den fjärde regionen och därigenom bevaras de till denna dag. Denna region har den äldsta daterade inskriptionen i hela Katakomberna - ett epitafium från 314 e.Kr. tillägnat en man vid namn Sisinnius.